公司用个人账户发工资被举报后员工补税的法律依据，主要源于《中华人民共和国税收征收管理法》对纳税义务和扣缴义务的规定。根据《中华人民共和国税收征收管理法》第六十三条，纳税人不缴或少缴应纳税款的需补缴税款及滞纳金，扣缴义务人未履行代扣代缴义务的也需承担相应责任。员工作为工资薪金的纳税义务人，无论公司以何种账户发工资，均需按规定缴纳个税。若公司用个人账户发工资却未代扣代缴，员工的纳税义务未免除，需补缴税款；若公司已代扣但未代缴，税务机关会向公司追缴，员工无需重复补税。因此，员工是否补税的核心在于个税是否实际缴纳，而非工资发放账户类型。
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针对公司用个人账户发工资被举报后员工是否要补税的问题，需结合具体情况判断。以下为不同情形的详细说明：员工是否补税需视公司是否已代扣代缴个税而定。1.若公司已通过个人账户发放工资时依法代扣代缴个税：员工无需补税，公司仅因发放渠道违规面临处罚，员工个税义务已履行。2.若公司未代扣代缴个税：员工需补缴少缴或未缴的税款，同时可能产生滞纳金；若公司构成偷税，员工作为纳税义务人需配合税务机关补税。3.若员工与公司恶意串通通过个人账户逃税：员工需补税，还可能因共同违法面临税务处罚。
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公司用个人账户发工资被举报后，存在以下特殊情况会影响处理结果：1.公司已将个税代扣但未代缴：此时税务机关会向公司追缴税款、滞纳金及罚款，员工无需补税，仅需配合提供工资发放证据。这种情况下员工的责任较轻，重点是证明公司已代扣个税。2.员工已离职且超过追征期限：若公司未缴个税，税务机关的追征期限为3年（特殊情况5年，偷税、抗税、骗税无期限）。若员工离职超过3年且公司未构成偷税，税务机关可能不再追征，员工无需补税。3.公司因破产无法补缴：若公司破产且无财产可供执行，税务机关可能无法追缴公司未缴的个税，此时员工是否补税需视税务机关认定，若员工无过错，可能无需承担补税责任。
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公司用个人账户发工资被举报后，员工可能面临以下法律风险：1.补缴税款及滞纳金风险：若公司未代扣代缴个税，员工需补缴税款，同时税务机关会按日加收滞纳税款万分之五的滞纳金。例如：员工月工资1万元，公司未缴个税，1年累计未缴税额1.2万元，滞纳金可达1.2万×0.05%×365≈2190元。2.税务处罚风险：若员工与公司恶意串通逃税，税务机关可对员工处不缴或少缴税款50%以上5倍以下的罚款。例如：员工明知公司通过个人账户发工资逃税仍接受，税务机关查实后可对其处税款1倍的罚款，即1.2万元罚款。

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